Придерживайтесь одного стиля на протяжении всего текста.
По возможности используйте одни условные обозначения,
одни и те же сущности отображайте одним цветом и называйте/сокращайте одинаково.
Шрифт тоже лучше один использовать, если получится, то в одном размере.
Если несколько человек работает над иллюстрациями – договоритесь об этом сразу.
Да, график вы рисуете в matplotlib или plotly, схему метода – в diagrams.net (ex draw.io),
а визуализации делаете инструментами PyTorch, а то и вовсе сохраняете скриншот из Meshlab
(и сверху в Paint что-то подрисовываете). Понимаю. Но старайтесь все делать как можно более похожим.